Die Gemeindeleitung der FEG Thusis besteht aus dem Pastor und der Gemeindeleiter. Sie leiten die Gemeinde organisatorisch in geistlicher Verantwortung voreinander, vor der Gemeinde und vor Gott.

Die Gemeindeleitung führen die Gemeinde insgesamt geistlich und betreuen sie seelsorgerlich. Sie vertritt die Gemeinde nach aussen, führt die laufenden Geschäfte, regelt das Anstellungsverhältnis des Pastors und der Angestellten.